一、增值稅：初級農(nóng)產(chǎn)品稅率9%；非初級農(nóng)產(chǎn)品稅率13%；征收率3%（減按1%）
1、種植環(huán)節(jié)優(yōu)惠
1）農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售的“自產(chǎn)”農(nóng)產(chǎn)品免征增值稅。農(nóng)產(chǎn)品同時滿足以下條件：（1）從事種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、林業(yè)、牧業(yè)、水產(chǎn)業(yè)的單位和個人生產(chǎn)的初級農(nóng)產(chǎn)品免征增值稅；（2）農(nóng)產(chǎn)品應當是列入《農(nóng)業(yè)產(chǎn)品征稅范圍注釋》(財稅字〔1995〕52號印發(fā))的初級農(nóng)業(yè)產(chǎn)品。*“農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者”是指直接從事農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的單位和個人，不包括農(nóng)產(chǎn)品加工企業(yè)。
2）農(nóng)民專業(yè)合作社：對農(nóng)民專業(yè)合作社銷售本社成員生產(chǎn)的農(nóng)業(yè)產(chǎn)品，視同農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售自產(chǎn)農(nóng)業(yè)產(chǎn)品免征增值稅。
3）采取“公司＋農(nóng)戶”經(jīng)營模式從事畜禽飼養(yǎng)，納稅人回收再銷售畜禽，屬于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品，免征增值稅。
4）制種企業(yè)在特定生產(chǎn)經(jīng)營模式下，生產(chǎn)銷售種子屬于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售自產(chǎn)農(nóng)業(yè)產(chǎn)品免征增值稅：（1）制種企業(yè)利用自有土地或承租土地，雇傭農(nóng)戶或雇工進行種子繁育，再經(jīng)烘干、脫粒、風篩等深加工后銷售種子；（2）制種企業(yè)提供親本種子委托農(nóng)戶繁育并從農(nóng)戶手中收回，再經(jīng)烘干、脫粒、風篩等深加工后銷售種子。*對企業(yè)外購苗木種植一段時間后再銷售，可以視同自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品免繳增值稅。
2、加工環(huán)節(jié)優(yōu)惠
自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品初加工后屬于列舉的初級農(nóng)業(yè)產(chǎn)品范圍：免征增值稅；銷售外購農(nóng)產(chǎn)品、外購農(nóng)產(chǎn)品加工后銷售征收增值稅：屬于《農(nóng)業(yè)產(chǎn)品征稅范圍注釋》列舉的初級農(nóng)產(chǎn)品范圍適用9%，不屬于列舉的范圍適用13%稅率。
3、流通環(huán)節(jié)優(yōu)惠
1）對承擔糧食收儲任務的國有糧食購銷企業(yè)銷售糧食、大豆免征增值稅，并可對免稅業(yè)務開具增值稅專用發(fā)票。其他糧食企業(yè)：軍隊用糧、救災救濟糧、水庫移民口糧免征增值稅。
2）從事蔬菜批發(fā)、零售的納稅人銷售的蔬菜免征增值稅。蔬菜是指可作副食的草本、木本植物，包括各種蔬菜、菌類植物和少數(shù)可作副食的木本植物。蔬菜的主要品種參照《蔬菜主要品種目錄》執(zhí)行。經(jīng)挑選、清洗、切分、晾曬、包裝、脫水、冷藏、冷凍等工序加工的蔬菜，屬于本通知所述蔬菜的范圍。各種蔬菜罐頭不屬于本通知所述蔬菜的范圍。蔬菜罐頭是指蔬菜經(jīng)處理、裝罐、密封、殺菌或無菌包裝而制成的食品。納稅人既銷售蔬菜又銷售其他增值稅應稅貨物的，應分別核算蔬菜和其他增值稅應稅貨物的銷售額;未分別核算的，不得享受蔬菜增值稅免稅政策。
3）從事農(nóng)產(chǎn)品批發(fā)、零售的納稅人銷售的部分鮮活肉蛋產(chǎn)品免征增值稅。免征增值稅的鮮活肉產(chǎn)品，是指豬、牛、羊、雞、鴨、鵝及其整塊或者分割的鮮肉、冷藏或者冷凍肉，內(nèi)臟、頭、尾、骨、蹄、翅、爪等組織。免征增值稅的鮮活蛋產(chǎn)品，是指雞蛋、鴨蛋、鵝蛋，包括鮮蛋，冷藏蛋以及對其進行破殼分離的蛋液、蛋黃和蛋殼。不包括《中華人民共和國野生動物保護法》所規(guī)定的國家珍貴、瀕危野生動物及其鮮活肉類、蛋類產(chǎn)品。從事農(nóng)產(chǎn)品批發(fā)、零售的納稅人既銷售部分鮮活肉蛋產(chǎn)品又銷售其他增值稅應稅貨物的，應分別核算上述鮮活肉蛋產(chǎn)品和其他增值稅應稅貨物的銷售額；未分別核算的，不得享受部分鮮活肉蛋產(chǎn)品增值稅免稅政策。
4）對邊銷茶生產(chǎn)企業(yè)銷售自產(chǎn)的邊銷茶及經(jīng)銷企業(yè)銷售的邊銷茶免征增值稅。是指以黑毛茶、老青茶、紅茶末、綠茶為主要原料，經(jīng)過發(fā)酵、蒸制、加壓或者壓碎、炒制，專門銷往邊疆少數(shù)民族地區(qū)的緊壓茶、方包茶（馬茶）。
4、對從事農(nóng)業(yè)機耕、排灌、病蟲害防治、植保、農(nóng)牧保險以及相關技術培訓業(yè)務，家禽、牲畜、水生動物的配種和疾病防治工作所取得的收入，免征增值稅。
4、土地租賃環(huán)節(jié)優(yōu)惠
1）納稅人將國有農(nóng)用地出租給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)，免征增值稅。2）將土地使用權轉讓給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)，免征增值稅。3）納稅人采取轉包、出租、互換、轉讓、入股等方式將承包地流轉給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者用于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)，免征增值稅。
5、農(nóng)產(chǎn)品增值稅抵扣：
1）按收購發(fā)票計算抵扣：開具收購發(fā)票的，以農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買價和9%的扣除率計算進項稅額。反向開具農(nóng)產(chǎn)品的范圍：限于農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者個人
2）按銷售發(fā)票計算抵扣：取得農(nóng)產(chǎn)品銷售發(fā)票的，以銷售發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買價和9%的扣除率計算進項稅額。農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者個人自開數(shù)電發(fā)票：自產(chǎn)自銷農(nóng)產(chǎn)品手機上可以代開自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品發(fā)票。
3）按3%專票計算抵扣：從小規(guī)模納稅人處取得增值稅專用發(fā)票的，以增值稅專用發(fā)票上注明的金額和9%的扣除率計算進項稅額。1%專票：取得小規(guī)模納稅人開具的1%增值稅專用發(fā)票，只能抵扣1%，不可以抵9%（或10%）。從按照簡易計稅方法依照3%征收率計算繳納增值稅的小規(guī)模納稅人取得的增值稅普通發(fā)票，不得作為計算抵扣進項稅額的憑證。批發(fā)、零售開具的免稅發(fā)票不能計算抵扣。
4）一般納稅人開具的增值稅專用發(fā)票。
5）海關進口增值稅專用繳款書。
6）1%加計抵扣：納稅人購進用于生產(chǎn)或委托加工13%稅率貨物的農(nóng)產(chǎn)品，按照10%的扣除率計算進項稅額。加計抵扣時間：領用農(nóng)產(chǎn)品時加計。納稅人購進農(nóng)產(chǎn)品既用于生產(chǎn)銷售或委托加工13%稅率貨物又用于生產(chǎn)銷售其他貨物服務的：應當分別核算用于生產(chǎn)銷售或委托受托加工13%稅率貨物和其他貨物服務的農(nóng)產(chǎn)品進項稅額。未分別核算的，統(tǒng)一以增值稅專用發(fā)票或海關進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額為進項稅額，或以農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票或銷售發(fā)票上注明的農(nóng)產(chǎn)品買價和9%的扣除率計算進項稅額。
7）農(nóng)產(chǎn)品核定扣除：（1）投入產(chǎn)出法；（2）成本法；（3）參照法。
二、企業(yè)所得稅
1、種植環(huán)節(jié)
1）銷售自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品免征企業(yè)所得稅：（1）蔬菜、谷物、薯類、油料、豆類、棉花、麻類、糖料、水果、堅果的種植；（2）農(nóng)作物新品種的選育；（3）中藥材的種植；（4）林木的培育和種植；（5）牲畜、家禽的飼養(yǎng)；（6）林產(chǎn)品的采集；（7）遠洋捕撈。減半征收企業(yè)所得稅：（1）花卉、茶以及其他飲料作物和香料作物的種植；（2）海水養(yǎng)殖、內(nèi)陸?zhàn)B殖。*企業(yè)從事國家限制和禁止發(fā)展的項目，不得享受企業(yè)所得稅減免優(yōu)惠。
2）企業(yè)將購入的農(nóng)、林、牧、漁產(chǎn)品，在自有或租用的場地進行育肥、育秧等再種植、養(yǎng)殖，經(jīng)過一定的生長周期，使其生物形態(tài)發(fā)生變化，且并非由于本環(huán)節(jié)對農(nóng)產(chǎn)品進行加工而明顯增加了產(chǎn)品的使用價值的，可視為農(nóng)產(chǎn)品的種植、養(yǎng)殖項目享受相應的稅收優(yōu)惠。主管稅務機關對企業(yè)進行農(nóng)產(chǎn)品的再種植、養(yǎng)殖是否符合上述條件難以確定的，可要求企業(yè)提供縣級以上農(nóng)、林、牧、漁業(yè)政府主管部門的確認意見。
3）"公司＋農(nóng)戶"經(jīng)營模式：自2010年1月1日起，以“公司＋農(nóng)戶”經(jīng)營模式從事農(nóng)、林、牧、漁業(yè)項目生產(chǎn)的企業(yè)，可以享受減免企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策。采取“公司＋農(nóng)戶”經(jīng)營模式從事牲畜、家禽的飼養(yǎng)，即公司與農(nóng)戶簽訂委托養(yǎng)殖合同，向農(nóng)戶提供畜禽苗、飼料、獸藥及疫苗等(所有權〈產(chǎn)權〉仍屬于公司)，農(nóng)戶將畜禽養(yǎng)大成為成品后交付公司回收。
2、加工環(huán)節(jié)
1）自產(chǎn)或外購農(nóng)產(chǎn)品初加工適用企業(yè)所得稅減半優(yōu)惠的種植、養(yǎng)殖項目，并直接進行初加工且符合農(nóng)產(chǎn)品初加工目錄范圍的，企業(yè)應合理劃分不同項目的各項成本、費用支出，分別核算種植、養(yǎng)殖項目和初加工項目的所得，并各按適用的政策享受稅收優(yōu)惠。外購的農(nóng)產(chǎn)品、外購初加工的農(nóng)產(chǎn)品直接銷售不能享受企業(yè)所得稅減免。
2）農(nóng)產(chǎn)品初加工服務：農(nóng)產(chǎn)品進行初加工服務,其所收取的加工費,免征企業(yè)所得稅。
3）自產(chǎn)或外購農(nóng)產(chǎn)品精加工銷售分別核算是否享受企業(yè)所得稅減免？不能！
三、個人所得稅優(yōu)惠
1、對個人或個體戶從事種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、飼養(yǎng)業(yè)、捕撈業(yè)，且經(jīng)營項目屬于農(nóng)業(yè)稅（包括農(nóng)業(yè)特產(chǎn)稅）、牧業(yè)稅征稅范圍的，其取得的“四業(yè)”所得暫不征收個人所得稅。
2、對個人獨資企業(yè)和合伙企業(yè)從事種植業(yè)、養(yǎng)殖業(yè)、飼養(yǎng)業(yè)和捕撈業(yè)，其投資者取得的“四業(yè)”所得暫不征收個人所得稅。銷售的是外購的農(nóng)產(chǎn)品，需要繳納個人所得稅。
3、個人取得青苗補償收入免征個人所得稅。
四、印花稅優(yōu)惠
1、的收購部門與村民委員會、農(nóng)民個人書立的農(nóng)副產(chǎn)品收購合同，免納印花稅。
2、對商品儲備管理公司及其直屬庫營業(yè)賬簿免征印花稅；對其承擔商品儲備業(yè)務過程中書立的買賣合同免征印花稅，對合同其他各方當事人應繳納的印花稅照章征收。
3、農(nóng)民、家庭農(nóng)場、農(nóng)民專業(yè)合作社、農(nóng)村集體經(jīng)濟組織、村民委員會購買農(nóng)業(yè)生產(chǎn)資料或者銷售農(nóng)產(chǎn)品書立的買賣合同和農(nóng)業(yè)保險合同免征印花稅。
4、對增值稅小規(guī)模納稅人、小型微利企業(yè)和個體工商戶減半征收印花稅。
五、房產(chǎn)稅、土地使用稅優(yōu)惠
1、對農(nóng)產(chǎn)品批發(fā)市場、農(nóng)貿(mào)市場(包括自有和承租)專門用于經(jīng)營農(nóng)產(chǎn)品的房產(chǎn)，暫免征收房產(chǎn)稅和城鎮(zhèn)土地使用稅。對同時經(jīng)營其他產(chǎn)品的農(nóng)產(chǎn)品批發(fā)市場和農(nóng)貿(mào)市場使用的房產(chǎn)，按其他產(chǎn)品與農(nóng)產(chǎn)品交易場地面積的比例確定征免房產(chǎn)稅和城鎮(zhèn)土地使用稅。
2、對商品儲備管理公司及其直屬庫自用的承擔商品儲備業(yè)務的房產(chǎn)、土地，免征房產(chǎn)稅、城鎮(zhèn)土地使用稅。
3、對農(nóng)林牧漁業(yè)的生產(chǎn)用地和農(nóng)民居住用房屋及土地，不征收房產(chǎn)稅和土地使用稅。
4、對增值稅小規(guī)模納稅人、小型微利企業(yè)和個體工商戶減半征收房產(chǎn)稅。