# 單一菌種|菌種鑒定檢測(cè) >
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針對(duì)純化后單一純菌株做菌種身份確認(rèn),區(qū)分:細(xì)菌、真菌(酵母 /霉菌),輸出屬、種,部分可做到亞種 / 菌株水平,可出具 CMA/CNAS報(bào)告,用于科研、申報(bào)、保藏、生產(chǎn)質(zhì)控、專利、培養(yǎng)基驗(yàn)證等場(chǎng)景。
16S rRNA 細(xì)菌:通用細(xì)菌鑒定,到種水平; ITS rRNA真菌(霉菌、酵母):真菌; 部分需要更高分辨率:gyrB、rpoB、calmodulin等基因,區(qū)分近緣種。
流程:菌株 DNA 提取→PCR 擴(kuò)增目標(biāo)基因→測(cè)序→序列比對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)(NCBI、EzBioCloud、UNITE)→給出菌種名稱+ 相似度。
生化反應(yīng)、碳源利用、藥敏、培養(yǎng)形態(tài); 局限:近緣菌種區(qū)分不開(kāi),一般配合分子,很少單獨(dú)作為終判定。
快速,蛋白指紋圖譜; 適合大批量已知庫(kù)內(nèi)菌株;數(shù)據(jù)庫(kù)沒(méi)有的菌株,需要測(cè)序復(fù)核。
? 常規(guī)單一菌種鑒定:優(yōu)先選16S/ITS 測(cè)序鑒定。
樣品形式三選一
斜面培養(yǎng)物(瓊脂斜面,新鮮活化,無(wú)雜菌)
平板單菌落:已經(jīng)純化,沒(méi)有雜斑,不能混多種菌
菌液:純化過(guò)夜菌液,無(wú)渾濁雜菌污染
? 如果是混合菌,不能做單一菌種鑒定,需要先分離純化出單菌落。
送樣注意
不建議干粉長(zhǎng)期老化菌株;老化、污染會(huì)直接鑒定失敗。
標(biāo)注:預(yù)估類型(細(xì)菌 / 霉菌 / 酵母)、來(lái)源、編號(hào)。
菌株編號(hào)、送檢樣品描述
測(cè)序基因序列(16S/ITS)
數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)結(jié)果、相似度
鑒定結(jié)果:屬 + 種名
備注:相似度判斷說(shuō)明,是否存在近緣種區(qū)分局限; 可選擇 CMA/CNAS資質(zhì)蓋章,用于項(xiàng)目申報(bào)、環(huán)評(píng)、肥料、微生物制劑備案。
實(shí)驗(yàn)室分離得到一株菌,確認(rèn)是什么菌
微生物肥料、益生菌、發(fā)酵菌株身份核驗(yàn)
專利、論文菌種鑒定
污染溯源(分離出單一污染菌,鑒定)
菌種保藏前身份確認(rèn)
測(cè)序鑒定:3?7 個(gè)工作日(不含菌株活化純化時(shí)間;如果樣品污染,需要客戶重新純化)
MALDI?TOF:1?3 個(gè)工作日(庫(kù)內(nèi)菌株)
不是所有菌株都能 定到 “種”:部分近緣物種 16S 分辨率有限,只能定到屬,需要補(bǔ)充其它基因。
若是環(huán)境樣品(土壤、水),里面是混合菌群,不能直接做單一菌種鑒定,要先做分離純化得到單菌落。
為華檢測(cè)中心,全國(guó)28家分所實(shí)驗(yàn)室,安徽為華檢測(cè)技術(shù)有限公司擁有專業(yè)檢測(cè)資質(zhì),有食品檢測(cè)、環(huán)境檢測(cè)、輕工檢測(cè)、金屬檢測(cè)、高分子材料檢測(cè)、醫(yī)療器械檢測(cè)、計(jì)量校準(zhǔn)等全品類實(shí)驗(yàn)室,您將獲得專業(yè)、靠譜、高效的服務(wù)。詳情咨詢檢測(cè)工程師。
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許可項(xiàng)目:檢驗(yàn)檢測(cè)服務(wù);認(rèn)證服務(wù);接受司法機(jī)構(gòu)委托開(kāi)展專業(yè)鑒定服務(wù);農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全檢測(cè);建設(shè)工程質(zhì)量檢測(cè);雷電防護(hù)裝置檢測(cè);室內(nèi)環(huán)境檢測(cè);安全生產(chǎn)檢驗(yàn)檢測(cè);民用航空油料檢測(cè)服務(wù)(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)后方可開(kāi)展經(jīng)營(yíng)活動(dòng),具體經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目以相關(guān)部門(mén)批準(zhǔn)文件或許可證件為準(zhǔn))一般項(xiàng)目:環(huán)境保護(hù)監(jiān)測(cè);計(jì)量技術(shù)服務(wù);進(jìn)出口商品檢驗(yàn)鑒定;服裝、服飾檢驗(yàn)、整理服務(wù)
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