蛋白質功能分類-97SE亞洲精品一區(qū)メイリン モデルコレクション メイ_小受總是

COG/KOG功能分類

應用場景：

       基于 COG/KOG 數據庫進行蛋白質功能注釋，可以準確地確定orthologs 和 paralogs，這對于新測序的物種的功能注釋具有明顯的優(yōu)勢；此外，通過COG/KOG功能分類，可以預測同源蛋白家族的功能。

分析方法：

       使用 EggNOG 數據庫對蛋白進行 COG/KOG 注釋分析。COG/KOG數據庫按照功能一共可以分為二十六類，基于每種分類的蛋白數目，繪制柱形圖。

圖表展示：

注：蛋白 COG/KOG 功能分類柱形圖。 橫軸為 COG/KOG一級分類編號；縱軸為蛋白數目。圖例對每種一級分類編號給出了詳細功能描述。

亞細胞定位功能分類

應用場景：

      對蛋白進行亞細胞定位預測分析，獲得蛋白在細胞中的定位情況，有助于了解樣本蛋白的組織來源情況。例如，體液樣本中外泌蛋白比例較高，心肌樣本中線粒體蛋白比例較高，綠色葉片樣本中葉綠體蛋白含量較高。

分析方法：

       使用 WoLFPSORT 軟件（真核生物）/CELLO軟件（原核生物）對蛋白進行亞細胞定位預測分析?；诿糠N分類的蛋白數目，繪制餅圖。

圖表展示：

注：蛋白亞細胞結構定位分布餅圖。圖中展示了不同亞細胞結構種類中蛋白的數目。

Gene Ontology功能分類

應用場景：

      對蛋白進行功能分類，可以對蛋白所調節(jié)的功能有直觀的認識，從而了解生物功能可能發(fā)生的變化。

分析方法：

       基于 Gene Ontology 的功能注釋結果，從 BiologicalProcess、Cellular Component 及 Molecular Function 三個方面對 Level 2 的Term 進行統(tǒng)計?；诿糠N分類的蛋白數目，繪制條形圖。

圖表展示：

      注：蛋白 GO 二級功能分類條形圖。 橫軸為蛋白在分類中的數目，縱軸表示 GO的一級分類（Biological process/Cellular component/Molecularfunction）中的二級功能分類。圖中用不同顏色表示了 GO 的一級分類。