PSEA分析-岳讓我滿足她性饑渴,與女教師辦公室激情高清觀看視頻

應(yīng)用場景

       PSEA（Protein Set EnrichmentAnalysis）與傳統(tǒng)的富集分析不同，傳統(tǒng)的富集分析更加依賴差異蛋白，這涉及到差異閾值的設(shè)定，存在一定主觀性并且只能用于顯著差異的蛋白富集。而PSEA則不局限于差異蛋白，從蛋白集的富集角度出發(fā)，理論上更容易囊括細(xì)微但協(xié)調(diào)性的變化對生物通路的影響，故能兼顧差異較小的蛋白尤其是差異倍數(shù)不太大的蛋白集?？蛇x的富集功能為Gene Ontology功能，KEGG通路。

分析方法

       使用GSEA軟件對所有蛋白在比較組中表達(dá)量的變化 Ratio值進(jìn)行排序，排序之后的蛋白列表頂部可以看作是上調(diào)蛋白，底部是下調(diào)蛋白。PSEA分析-岳讓我滿足她性饑渴,與女教師辦公室激情高清觀看視頻的是一個(gè)功能集下的所有蛋白在這個(gè)排序列表的頂部或者底部富集，如果在頂部富集，該功能集是上調(diào)趨勢；反之，如果在底部富集，則是下調(diào)趨勢。

圖表展示

      注：PSEA分析-岳讓我滿足她性饑渴,與女教師辦公室激情高清觀看視頻結(jié)果表格。其中NAME為通路的名字；SIZE代表該通路下的蛋白在排好序的蛋白列表中的數(shù)目；ES代表Enrichmentscore，大于0 表示通路在列表的頂部富集，小于0表示通路在列表的底部富集；NES代表歸一化后的Enrichmentscore；NOM p-val代表富集顯著性p value；FDR q-val代表多重假設(shè)檢驗(yàn)校正后的p值；FWERp-val代表的也是多重假設(shè)檢驗(yàn)校正后的p值，較FDR q-val更嚴(yán)格。

       注：PSEA顯著富集通路條形圖。橫坐標(biāo)為NES值，縱坐標(biāo)為富集到的功能或通路。其中紅色為顯著富集到有序蛋白列表頂端的通路，綠色為顯著富集到有序蛋白列表底端的通路。

      注：PSEA富集結(jié)果圖。分成三個(gè)部分，第一部分為蛋白EnrichmentScore的折線圖，橫軸為根據(jù)比較組中表達(dá)量變化的 Ratio 值由大到小排序的蛋白，縱軸為該通路下蛋白對應(yīng)的RunningES，折線圖的峰值就是這個(gè)通路的Enrichmentscore。第二部分為hit，用線條標(biāo)記位于該通路下的蛋白在有序列表中的位置。第三部分為所有蛋白的Ratio值的分布圖。

參考文獻(xiàn)

       Aravind, Subramanian, Pablo, et al. Geneset enrichment analysis: a knowledge-based approach forinterpreting genome-wide expression profiles.[J]. Proceedings ofthe National Academy of Sciences of the United States of America,2005.