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應(yīng)用場景

      二級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈借助于氫鍵沿一維方向排列成具有周期性的結(jié)構(gòu)的構(gòu)象,是多肽鏈局部的空間結(jié)構(gòu)(構(gòu)象),主要有α-螺旋、β-折疊和無規(guī)則卷曲(Coil)三種形式。不同蛋白質(zhì)翻譯后修飾發(fā)生位置在蛋白二級結(jié)構(gòu)上具有一定差異化選擇。例如在某些情況下,蛋白質(zhì)的磷酸化位點(diǎn)傾向于發(fā)生在無規(guī)則卷曲區(qū)域內(nèi);而在其他情況下,則傾向發(fā)生在結(jié)構(gòu)良好的區(qū)域。該分析結(jié)果用于評估修飾蛋白中修飾氨基酸二級結(jié)構(gòu)的偏好性選擇。

分析方法

       采用 NetSurfP1.0 軟件進(jìn)行二級結(jié)構(gòu)分析,然后 WilcoxonRank Sum 檢驗(yàn)方法計(jì)算顯著差異變化 p value。

圖表展示

      注:蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)二級結(jié)構(gòu)分布統(tǒng)計(jì)圖。橫軸表示蛋白質(zhì)的三種二級結(jié)構(gòu),縱軸為蛋白特定氨基酸位置上三種二級結(jié)構(gòu)的平均概率。藍(lán)色表示沒有發(fā)生修飾的賴氨酸,橙色表示發(fā)生修飾的賴氨酸。

參考文獻(xiàn)

       Yaseen, A. , & Li, Y. . (2014).Context-based features enhance protein secondary structureprediction accuracy. Journal ofChemical Information & Modeling, 54(3),992-1002.


更新時(shí)間
黃金會員
第1年
統(tǒng)一社會信用代碼
913301015660820843
成立日期
2010年12月30日
法定代表人
程仲毅
注冊資本
36000

主營產(chǎn)品

蛋白質(zhì)組學(xué)、蛋白質(zhì)修飾組學(xué)、生物信息與數(shù)據(jù)服務(wù)、抗體試劑

經(jīng)營范圍

一般項(xiàng)目:醫(yī)學(xué)研究和試驗(yàn)發(fā)展;第一類醫(yī)療器械生產(chǎn);第一類醫(yī)療器械銷售;第二類醫(yī)療器械銷售;貨物進(jìn)出口;技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù):生物試劑、疾病診斷試劑;批發(fā)、零售:生物試劑(涉及前置審批的項(xiàng)目除外)(除依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目外,憑營業(yè)執(zhí)照依法自主開展經(jīng)營活動(dòng))。許可項(xiàng)目:第二類醫(yī)療器械生產(chǎn)(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目,經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng),具體經(jīng)營項(xiàng)目以審批結(jié)果為

公司簡介

        杭州景杰生物科技股份有限公司是由海內(nèi)外科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)與組織高層次歸國人士創(chuàng)建的一家以創(chuàng)新型平臺驅(qū)動(dòng)的高科技企業(yè)。公司集研發(fā)、生產(chǎn)與技術(shù)服務(wù)于一體,志在成為行業(yè)的開拓者與引領(lǐng)者。公司長期深耕蛋白質(zhì)組學(xué)產(chǎn)業(yè),以生物質(zhì)譜為核心工具,結(jié)合抗體試劑產(chǎn)品,整合生物化學(xué)、免疫學(xué)、分子生物學(xué)、生物信息學(xué)等多領(lǐng)域交叉學(xué)科,搭建了“高通量蛋白質(zhì)組分析+高特異性抗體開發(fā)的有機(jī)整合業(yè)務(wù)布局,是行業(yè)內(nèi)提供涵蓋蛋白質(zhì)“發(fā)現(xiàn)”、“驗(yàn)證”以及“檢測”的蛋白...

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