蛋白質(zhì)功能富集分析-日韓精品免費(fèi)一線在線觀看|被強(qiáng)j高H純?nèi)夤卉噉p老師
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高通量蛋白質(zhì)組學(xué)分析往往會(huì)得到大量差異表達(dá)蛋白，簡單的統(tǒng)計(jì)很難將這些差異蛋白與某個(gè)待研究的生物學(xué)現(xiàn)象及其潛在機(jī)制聯(lián)系起來。功能富集分析可以幫助我們快速從龐雜的組學(xué)數(shù)據(jù)中發(fā)掘規(guī)律，期望發(fā)現(xiàn)在生物學(xué)過程中起關(guān)鍵作用的生物通路，從而揭示和理解生物學(xué)過程的基本分子機(jī)制。
富集分析采用ue檢驗(yàn)方法檢測待測功能集在差異蛋白中是否顯著富集。這些功能集可以是 Gene Ontology 功能、KEGG通路、蛋白結(jié)構(gòu)域、Complex（復(fù)合體）等。富集分析結(jié)果通常用富集程度（fold enrichment），富集顯著性（pvalue）兩個(gè)特征來描述差異蛋白在指定功能集中的富集情況，當(dāng) p value < 0.05時(shí)認(rèn)為富集是具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的。
1) GO富集分析
注 ：顯著富集 GO 功能氣泡圖。 橫軸表示 log2 轉(zhuǎn)換的富集倍數(shù)；縱軸為 GO功能描述。點(diǎn)的顏色表示富集顯著性，紅色代表富集顯著性強(qiáng)；點(diǎn)的大小表示 GO 功能分類中差異蛋白個(gè)數(shù)。
注：GO 功能有向無環(huán)網(wǎng)絡(luò)圖。 紅色代表極顯著富集 GO 分類，黃色代表顯著富集GO 分類，藍(lán)色代表非顯著富集 GO分類，帶箭頭的連線表示 GO 分類的上下層級(jí)關(guān)系，點(diǎn)的大小代表富集程度。
2) KEGG富集分析
注：顯著富集 KEGG 通路氣泡圖。 橫軸表示 log2 轉(zhuǎn)換的富集倍數(shù)；縱軸為 KEGG通路描述。點(diǎn)的顏色表示富集顯著性，紅色代表富集顯著性強(qiáng)；點(diǎn)的大小表示 KEGG 通路中差異蛋白個(gè)數(shù)。
注：差異表達(dá)蛋白顯著富集KEGG通路圖。紅色代表差異上調(diào)蛋白，綠色代表差異下調(diào)蛋白，黃色代表同時(shí)存在差異上調(diào)和差異下調(diào)蛋白。
3) 蛋白結(jié)構(gòu)域富集分析
注 ：顯著富集蛋白結(jié)構(gòu)域氣泡圖。 橫軸表示 log2轉(zhuǎn)換的富集倍數(shù)；縱軸為蛋白結(jié)構(gòu)域描述。點(diǎn)的顏色表示富集顯著性，紅色代表富集顯著性強(qiáng)；點(diǎn)的大小表示蛋白結(jié)構(gòu)域中差異蛋白個(gè)數(shù)。
4) 蛋白復(fù)合物富集分析
注：顯著富集蛋白復(fù)合物氣泡圖。 橫軸表示 log2轉(zhuǎn)換的富集倍數(shù)；縱軸為蛋白復(fù)合物。點(diǎn)的顏色表示富集顯著性，紅色代表富集顯著性強(qiáng)；點(diǎn)的大小表示蛋白復(fù)合物中差異蛋白個(gè)數(shù)（物種jinxian人、小鼠）。
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蛋白質(zhì)組學(xué)、蛋白質(zhì)修飾組學(xué)、生物信息與數(shù)據(jù)服務(wù)、抗體試劑
一般項(xiàng)目：醫(yī)學(xué)研究和試驗(yàn)發(fā)展；第一類醫(yī)療器械生產(chǎn)；第一類醫(yī)療器械銷售；第二類醫(yī)療器械銷售；貨物進(jìn)出口；技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)：生物試劑、疾病診斷試劑；批發(fā)、零售：生物試劑（涉及前置審批的項(xiàng)目除外）(除依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目外，憑營業(yè)執(zhí)照依法自主開展經(jīng)營活動(dòng))。許可項(xiàng)目：第二類醫(yī)療器械生產(chǎn)(依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項(xiàng)目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動(dòng)，具體經(jīng)營項(xiàng)目以審批結(jié)果為
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