飛凡檢測(cè)張同學(xué)今天與大家淺聊一下STR，首先什么是STR呢？

STR即短串聯(lián)重復(fù)序列（ShortTandem Repeats），也稱微衛(wèi)星DNA（microsatelliteDNA），是一段包含1-6bp的重復(fù)DNA序列。STR廣泛存在于原核動(dòng)物和真核動(dòng)物中，人類中也不例外，約占人類基因組的3%。由于其多態(tài)性和高突變率，STR在生物學(xué)研究中得到了廣泛的應(yīng)用，又被稱為細(xì)胞的DNA指紋。

由于STR技術(shù)的高靈敏度、自動(dòng)化程度高、準(zhǔn)確快速、重復(fù)性好等優(yōu)點(diǎn)，STR基因分型已被作為金標(biāo)準(zhǔn)應(yīng)用于細(xì)胞鑒定，由于細(xì)胞系交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)而導(dǎo)致研究錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)等情況的存在，因此建議在實(shí)驗(yàn)開展前進(jìn)行細(xì)胞的STR鑒定分析。

細(xì)胞STR鑒定即通過STR信息建立細(xì)胞系的遺傳特性，通過STR鑒定來檢測(cè)細(xì)胞是否發(fā)生交叉污染或者誤認(rèn)的情況。STR基因座位上的等位基因可通過擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列拷貝數(shù)的不同來區(qū)分，在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測(cè)來識(shí)別。隨后通過一定的計(jì)算方法，即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對(duì)，從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。

STR（Short TandemRepeat，短串聯(lián)重復(fù)序列）基因位點(diǎn)由長(zhǎng)度為3～7個(gè)堿基對(duì)的短串連重復(fù)序列組成，這些重復(fù)序列廣泛存在于人類基因組中，可作為高度多態(tài)性標(biāo)記，被稱為細(xì)胞的DNA指紋。STR基因座位上的等位基因可通過PCR擴(kuò)增區(qū)域內(nèi)重復(fù)序列的拷貝數(shù)的不同來區(qū)分，在毛細(xì)管電泳分離之后可通過熒光檢測(cè)來識(shí)別，隨后通過一定的計(jì)算方法，即可根據(jù)所得的STR分型結(jié)果與專業(yè)的細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫比對(duì)從而推算出樣品所屬的細(xì)胞系或可能的交叉污染的細(xì)胞系名稱。那么STR的鑒定結(jié)果能說明什么呢？STR的鑒定結(jié)果能證明以下問題： 1. 是否為人源細(xì)胞；2. 是否為標(biāo)準(zhǔn)細(xì)胞系；3.是否存在物種內(nèi)交叉污染。為什么要進(jìn)行STR鑒定？據(jù)統(tǒng)計(jì)，約18%~30%細(xì)胞系被交叉污染或錯(cuò)誤辨識(shí)，使用該細(xì)胞可能導(dǎo)致研究結(jié)論錯(cuò)誤、結(jié)果不可重復(fù)、臨床細(xì)胞治療災(zāi)難性后果等。2009年起，NIH和ATCC呼吁研究者對(duì)細(xì)胞進(jìn)行STR鑒定并著手建立細(xì)胞STR數(shù)據(jù)庫。如今，細(xì)胞STR鑒定已是鑒別細(xì)胞身份及交叉污染的金標(biāo)準(zhǔn)。多數(shù)**期刊也要求作者投稿時(shí)提供細(xì)胞STR鑒定證明?！吨袊?guó)藥典》中明確規(guī)定，新建細(xì)胞系/株、細(xì)胞庫和生產(chǎn)終末細(xì)胞應(yīng)進(jìn)行鑒別試驗(yàn)，以確認(rèn)為本細(xì)胞，且無其他細(xì)胞的交叉污染。