公司存在以下情況不能直接注銷
 1、公司有分支機構。如果想注銷母公司，那么需要先把子公司或分公司注銷掉，否則母公司是無法注銷的。
2、公司存在未完結(jié)的訴訟。若當公司存在未完結(jié)的訴訟，只有公司訴訟事項執(zhí)行完畢后，工商才會受理該公司的注銷。
3、公司名下有資產(chǎn)。公司資產(chǎn)分為有形資產(chǎn)（固定資產(chǎn)與流動資產(chǎn)）和無形資產(chǎn)。公司申請注銷，資產(chǎn)必須妥善處理。資產(chǎn)沒有處理或處理不當，不僅企業(yè)會有損失，而且影響注銷。
4、證照不齊全。如果公司的營業(yè)執(zhí)照或公司章丟失，會影響注銷的進度，需先補齊相關證照，才可以注銷。

注銷流程復雜繁瑣耗時長
公司注銷的一般流程是：清算組備案——企業(yè)信用系統(tǒng)公示——注銷稅務——注銷營業(yè)執(zhí)照——注銷銀行賬戶——注銷所有印章。
公司注銷，需要國稅局、地稅局、工商局、銀行之間來回跑。不懂流程的話來回跑的次數(shù)和浪費的時間會更多。如果資料準備不全或者有誤，需要重新準備......一般來說，公司注銷整個流程需要3個月左右，如果公司存在一些嚴重問題，比如，企業(yè)有罰款，或進入黑名單等，有可能需要一年半載才能注銷

稅務注銷難

整個注銷環(huán)節(jié)中，稅務問題是難處理的，倘若有問題，不僅需要補齊稅務，還有罰款和滯納金產(chǎn)生。 
1、無法提供憑證、賬本等
注銷公司時，稅局可能會查賬，需要提供近三年的記賬憑證、財務報表，如果公司長久以來沒有做賬、報稅或是中斷記賬的話，那就得先補賬。大部分公司都是因為這類的原因而導致無法注銷。
2、公司被列入非正常戶
公司因為沒有記賬報稅、逾期申報等原因被列入非正常戶，遇上這種情況，需要先把公司的異常情況解決掉，才能注銷。需要補稅，并且交罰款和滯納金（罰款金額以稅局核查為準）。
3、公司存在債務問題
公司有尚未繳納完畢的稅款、社保欠費、甚至是罰款，稅務也是無法注銷的！企業(yè)只有在繳納完稅費、社保還有罰款，才能繼續(xù)辦理注銷手續(xù)。