1.設備用途

SingleronJava自動化單細胞測序文庫構(gòu)建平臺可同時處理1-8個單細胞樣本，將單細胞懸液分散到微流控芯片中，并自動完成細胞分離、細胞裂解、細胞標記、核酸捕獲、反轉(zhuǎn)錄以及產(chǎn)物滅活的步驟。

細胞懸液注入流控芯片，根據(jù)"泊松分布"的原理完成單個細胞的分離。之后將攜帶獨特細胞標簽的磁珠加入到芯片微孔中，細胞裂解后，帶有獨特細胞標簽及分子標簽的磁珠通過與mRNA上的poly(A)尾結(jié)合捕獲mRNA，對細胞及mRNA進行標記。、設備的反轉(zhuǎn)錄模塊將磁珠捕獲的mRNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA并可進行滅活。該設備構(gòu)建的單細胞轉(zhuǎn)錄組文庫可用于單細胞的基因3’表達譜測序文庫構(gòu)建；T/B細胞單細胞水平3’免疫組庫全長測序文庫構(gòu)建；可完成單細胞聯(lián)合多組學分析，同時檢測單細胞轉(zhuǎn)錄組表達和表面蛋白組的表達、單細胞靶向基因檢測、單細胞糖基化水平檢測等不同應用。已廣泛用于神經(jīng)、發(fā)育、免疫、癌癥、輔助生殖等領域的研究。

2.設備基本參數(shù)

型號 SGR-WS-J8

名稱 SingleronJava自動化單細胞測序文庫構(gòu)建平臺

檢測通量8通量（兼容1-8通量）

外型尺寸810mm*460mm*630mm

木箱尺寸850mm*550mm*750mm

屏幕尺寸 18.5英寸

整機重量 65kg

耗材配套 常溫試劑8連排管：1.2mL（Java專用）

低溫試劑8連排管：1.2mL（Java專用）

RT帶蓋EP管：2mL（Java專用）

芯片：Java SD Chip/ Java HDChip

槍頭：帶濾芯200μL槍頭（Java專用）

3.設備技術性能參數(shù)

（1）技術原理：微流控微孔芯片物理沉降方法進行單細胞的分離和捕獲，并具有自糾錯分析標簽序列對每一個單細胞裂解后釋放出的mRNA進行捕獲和標記功能；反轉(zhuǎn)錄模塊運行試劑樣本在振蕩混勻和管內(nèi)溫度調(diào)溫的配合下進行反轉(zhuǎn)錄操作。

（2）運行通量：同時處理1~8通道，單個通道對應單張芯片，避免交叉污染及芯片浪費。

（3）細胞捕獲效率≥65%。

（4）多細胞率：檢測10000個細胞中含有雙細胞的比例≤2％。

（5）樣本類型：包括但不限于細胞、細胞核、原生質(zhì)體。

（6）系統(tǒng)可兼容不同規(guī)格芯片，包括常規(guī)芯片，高密度芯片，以此實現(xiàn)不同上樣細胞數(shù)的實驗需求。

（7）系統(tǒng)可以提供3’端單細胞轉(zhuǎn)錄組不少于100萬個獨立標簽標記的磁珠。

（8）自動完成8個樣本的芯片預處理、單細胞分離、細胞裂解、核酸捕獲及反轉(zhuǎn)錄全流程時間170分鐘。

（9）配備低溫存儲模塊，用于試劑低溫保存，溫控范圍2℃~4℃±1℃。

（10）系統(tǒng)使用一次性吸頭，避免交叉污染。

（11）系統(tǒng)適配0.6μL、2mL兩種標準管，包括但不限于常溫試劑離心管、低溫試劑離心管、 帶蓋離心管、帶濾芯 200μL槍頭。

（12）機械移液器具備8通道同時分液能力，以及單道移液分液能力，以適應各種移液模式的需要。

（13）配備金屬浴振蕩模塊，磁珠與樣品的充分混合，振蕩轉(zhuǎn)速200~2000rpm，振蕩振幅不小于2mm，振蕩溫度42℃±1℃。

（14）配備溫控孵育模塊，用于反轉(zhuǎn)錄與產(chǎn)物滅活的步驟，溫控范圍72℃±2℃，升溫時間60s，溫度調(diào)整與孵育時間由軟件控制與調(diào)用。

（15）移液泵移液精度=20μL(CV值<5 %)，移液泵移液精度>20μL(CV值<3%)；分液速度1~200μ/s可調(diào)，Zui低調(diào)整步幅0.5μL/s，以適應不同的液體的處理。

（16）系統(tǒng)包含操作流程組別15組，包括芯片預處理、mRNA 捕獲、RT 操作等操作程序，自主選擇與調(diào)用功能流程。

（17）支持遠程通知功能，智能化具備溫度控制、溫度監(jiān)測、開機自檢、RT洗滌合蓋、紫外臭氧滅菌等功能。?

（18）檢測樣本能力：可單檢、可混檢，具有細胞標簽技術，單張芯片支持不少于16個樣本混樣。

（19）可兼容測序平臺：兼容范圍不限于二代測序、三代測序平臺等。

（20）配備有 18.5 英寸屏幕，更加人性化操作。

4.設備應用

（1）可完成單細胞的基因3’端表達譜測序文庫，單細胞的基因表達定量分析，鑒定細胞類型，繪制和描述細胞群體，識別細胞異質(zhì)性，發(fā)現(xiàn)新的生物標志物。

（2）可完成T細胞/B細胞的單細胞水平的基因3’端免疫組庫（可變區(qū)、多變區(qū)、結(jié)合區(qū)）全長序列測序文庫構(gòu)建。

（3）可完成單細胞轉(zhuǎn)錄組動態(tài)監(jiān)測測序文庫構(gòu)建，實現(xiàn)在獲得樣本轉(zhuǎn)錄組信息的同時，還能在單細胞層面獲得各類細胞基于新舊RNA轉(zhuǎn)錄活躍度信息。

（4）可完成單細胞靶向基因突變檢測，使用預先設計或定制的靶向基因探針組合，對單細胞靶向基因位置區(qū)域捕獲，實現(xiàn)對特異性區(qū)域的突變基因靶向捕獲，將靶基因表達信息映射至轉(zhuǎn)錄組信息上。

（5）多組學聯(lián)合分析：可同時檢測細胞表面抗原和單細胞轉(zhuǎn)錄組，一次可檢測上百種細胞表面抗原；針對同一樣本，可同時制備單細胞的轉(zhuǎn)錄組文庫、T/B細胞的單細胞水平基因3’端免疫組庫、細胞表面蛋白的不同文庫、單細胞水平的靶向基因富集文庫、單細胞糖基化文庫等不同應用。

（6）提供生物信息學分析軟件，多文庫數(shù)據(jù)同步分析處理，同一數(shù)據(jù)流程保障一致性，生成表達矩陣及可視化分析報告，以高通量數(shù)字化形式解析細胞群體中所包含每個細胞的表達基因及其豐度。

（7）提供單細胞數(shù)據(jù)庫，可視化分析軟件，具有單細胞文章數(shù)據(jù)檢索、可視化及矩陣數(shù)據(jù)自動分析功能，獲得細胞分群、細胞注釋、組內(nèi)和組間差異基因表達分析等等，具備強大分析功能，可進行熱圖，火山圖，小提琴圖，云雨圖等分析。