按照我國《計算機軟件保護條例》，軟件著作權(quán)登記主管部門由國務(wù)院著作權(quán)行政管理部門認定。按照《計算機軟件著作權(quán)登記辦法》的規(guī)定，國家版權(quán)局認定中國版權(quán)保護中心為軟件登記機構(gòu)，經(jīng)國家版權(quán)局批準，中國版權(quán)保護中心可以在地方設(shè)立軟件登記辦事機構(gòu)。

關(guān)于軟件著作權(quán)登記的程序如下：

（1）軟件著作權(quán)申請所需提交的文件有計算機軟件著作權(quán)登記表、計算機軟件說明書、申請人身份證明等。

（2）計算機軟件權(quán)利人繼承備案申請所需提交的文件材料有權(quán)利繼承備案申請表、繼承證明文件、原登記證書等。

（3）變更與補充登記申請所需提交的文件資料有變更或補充登記申請表、有關(guān)變更及補充的材料、原登記證書等。

（4）計算機軟件權(quán)利轉(zhuǎn)移備案申請所需提交的文件資料有計算機軟件權(quán)利轉(zhuǎn)移申請表、轉(zhuǎn)讓（許可）合同書、原登記證書、國務(wù)院有關(guān)主管部門批文等。

（5）計算機軟件著作權(quán)續(xù)展申請所需提交的文件資料有計算機著作權(quán)續(xù)展申請表、原登記證書等。 

2．軟件著作權(quán)登記申請受理

軟件登記機構(gòu)根據(jù)《計算機軟件著作權(quán)登記辦法》第19條、20條、21條規(guī)定，對提交的文件進行檢查，確定是否受理，然后向申請者發(fā)出有關(guān)通知如下：

（1）受理通知書。通知申請者，其所提交的文件與資料符合受理條件，予以受理，并明確受理日期、受理編號。申請者接到受理通知后不必答復(fù)，等待下一步的審查結(jié)論。

（2）暫不受理通知書。說明申請者所提交的申請書及有關(guān)文件資料有欠缺。申請者在接到暫不受理通知書后應(yīng)該及時按要求補充有關(guān)文件資料，登記機構(gòu)再進行登記處理。

（3）不受理通知書。[陳松喬 任勝兵王國軍編著,軟件學(xué)院推薦教材 現(xiàn)代軟件工程,清華大學(xué)出版社,2004年06月第1版,第303頁]

3．軟件著作權(quán)登記申請的審查

登記機構(gòu)自受理日起120日內(nèi)，對申請者提供的文件資料從法律、技術(shù)等方面進行全面審查。對不符合《計算機軟件保護條例》或《計算機軟件著作權(quán)登記辦法》規(guī)定的申請，向申請者發(fā)書面補正通知書。申請者接到補正通知書后，應(yīng)及時進行補正處理，否則登記機構(gòu)將把登記申請自動撤回的決定通知申請者。在補正完成后，登記機構(gòu)再進行審查，向申請者發(fā)出準予登記決定通知書或者駁回登記申請通知書。 

4．軟件著作權(quán)登記注冊

申請者在收到準予登記的通知書后30日內(nèi)向登記機構(gòu)繳納登記證書費，登記機構(gòu)收到申請者繳納的登記證書費后辦理登記注冊，向申請者頒發(fā)登記證書。 

5．軟件著作權(quán)登記的異議與復(fù)審

對已登記、公布的軟件，若登記不符合《計算機軟件保護條例》或《計算機軟件著作權(quán)登記辦法》規(guī)定的，任何人都可向軟件登記機構(gòu)提出異議。登記機構(gòu)審查認為異議成立的應(yīng)撤銷登記，書面通知異議人和被異議人，并予以公布；異議不成立的，予以駁回。對因異議成立撤銷登記或駁回的決定不服的，當事人可在收到有關(guān)通知之日起60日內(nèi)向軟件登記復(fù)審委員會請求復(fù)審。復(fù)審委員會應(yīng)對受理的復(fù)審請求做出復(fù)審決定，并書面通知復(fù)審請求者。

以上是軟件著作權(quán)申請的具體程序，需要辦理的客戶可以咨詢代理公司更為簡便。