日本對(duì)企業(yè)法人實(shí)行屬地稅制，在日本從事經(jīng)濟(jì)活動(dòng)的法人企業(yè)都要就其經(jīng)濟(jì)活動(dòng)中所產(chǎn)生的利潤(rùn)在日本納稅。征稅主體為國(guó)家及地方政府（都道府縣及市町村），征稅對(duì)象為日本法人企業(yè)的全球收入及外國(guó)企業(yè)來(lái)源于日本境內(nèi)的收入，征稅主體對(duì)各個(gè)征稅對(duì)象擁有征稅權(quán)。當(dāng)征稅對(duì)象包括境外所獲利潤(rùn)時(shí)，為避免雙重征稅，制定了境外稅額抵扣的規(guī)定，在一定范圍內(nèi)，可從日本的應(yīng)繳稅款中扣除境外已繳納的稅款。在日本開展業(yè)務(wù)的跨國(guó)公司，當(dāng)其獲得一定的應(yīng)稅收入時(shí)，通過(guò)辦理源頭課征（即代扣代繳）或申報(bào)繳納的手續(xù)，計(jì)算和繳納應(yīng)征稅額。為避免雙重征稅和逃稅的發(fā)生，中國(guó)政府與日本政府于1984年簽署了《中日租稅條約》，1991年中國(guó)外資法改訂后，雙方政府又進(jìn)行換文重新確認(rèn)了某些變更條款。

日本針對(duì)企業(yè)和個(gè)人所得征收9種稅，包括6種國(guó)稅——法人稅、復(fù)興特別法人稅、個(gè)人所得稅、復(fù)興特別法人稅、繼承稅、贈(zèng)與稅；3種地方稅——都道府縣民稅、事業(yè)稅、市町村民稅。針對(duì)流通交易征收4種稅，包括兩種國(guó)稅——登記許可稅、印花稅；兩種地方稅——房地產(chǎn)購(gòu)置稅、汽車購(gòu)置稅。此外，日本還針對(duì)消費(fèi)和財(cái)產(chǎn)的所有、轉(zhuǎn)移等征收消費(fèi)稅、遺產(chǎn)稅、贈(zèng)與稅等其他約19種稅目。

稅款的繳納主要有以下幾種方式：自行申報(bào)納稅方式（納稅義務(wù)人自行確定稅額，提交納稅申報(bào)表）；賦稅決定方式（征稅主體確定稅額后，發(fā)出稅額的通知）；代扣代繳方式（代扣代繳義務(wù)人在支付應(yīng)稅所得時(shí)，代扣所得稅）；已向商品征稅，或在支付價(jià)格上另加稅額）；其他。